ฐานะการเงิน ณ วันสิ้นปีบัญชี 2562 กนอ. มีสินทรัพย์รวม 28,005 ล้านบาท หนี้สินรวม 12,192 ล้านบาท และส่วนของทุนรวม 15,813 ล้านบาท คิดเป็นสัดส่วนหนี้สินต่อทุนเท่ากับ 0.8:1
ผลการดำเนินงานในปี 2562 กนอ. มีกำไรสุทธิจำนวน 3,146 ล้านบาท เพิ่มขึ้นจากปี 2561 จำนวน 810 ล้านบาท หรือเพิ่มขึ้นร้อยละ 35 เป็นการเพิ่มขึ้นของรายได้จากการดำเนินงานหลัก ประกอบด้วย
1. รายได้จากการขายที่ดินในนิคมฯ ภาคใต้ จำนวน 154 ล้านบาท
2. รายได้ค่าเช่าที่ดินเพิ่มขึ้น 175 ล้านบาท เป็นการปรับอัตราค่าเช่าที่ดิน
3. รายได้จากการร่วมดำเนินงานเพิ่มขึ้น 9 ล้านบาท จากค่ากำกับการบริการ
4. รายได้ค่าธรรมเนียมและอื่นๆ เพิ่มขึ้น 2 ล้านบาท
5. รายได้จากสินทรัพย์รับบริจาคเพิ่มขึ้น 576 ล้านบาท ส่วนใหญ่มาจากการรับมอบที่ดินจาก บริษัท สหรัตนนคร จำกัด ตามที่ศาลล้มละลายกลางได้มีคำสั่งพิทักษ์ทรัพย์ โดยคดีถึงที่สุด ได้รับโอนกรรมสิทธิ์ที่ดินรวม 49 แปลง
6. รายได้ค่าบริการสาธารณูปโภคลดลง 29 ล้านบาท สาเหตุจากผู้ประกอบการในนิคมฯ มาบตาพุด และนิคมฯ สมุทรสาคร มีกำลังผลิตลดลงและยกเลิกสัญญา ส่งผลให้รายได้ค่าน้ำดิบและน้ำประปาลดลง
7. รายได้จากการดำเนินงานท่าเทียบเรือลดลง 18 ล้านบาทสาเหตุจากปริมาณเรือผ่านท่าและสินค้าผ่านท่าลดลง
ค่าใช้จ่ายรวมเพิ่มขึ้นจำนวน 181 ล้านบาท ส่วนใหญ่เป็นการเพิ่มขึ้นของต้นทุนค่าขายที่ดิน ค่าเสื่อมราคา ค่าต่อสัญญาเช่าที่ดินกับการท่าเรือแห่งประเทศไทยและกรมธนารักษ์ ค่าบริหารจัดการท่าเรือ และค่าผลประโยชน์พนักงานจากการเกษียณอายุ
